![]() Results showed that these identified five transporters were expressed more under Benzothiadiazole (BTH) compared to other treatments. The expression heat map and co-expression networks were constructed with these identified proteins. ![]() The five out of 10 identified BOR1 transporters (StBOR1-2,4,5, and 10) were found in the transcriptomic data. In this study, BOR1-type B transporters in potato (Solanum tuberosum) was identified and characterized through bioinformatical approaches. There are several transporters having a role in B transport in plants. Ayrıca, bu proteinlerinin B alınımı ve depolanma mekanizmasındaki rolleri gelecek araştırmalarda ele alınabilir.īoron (B) is an important micro element for plant metabolism. Özellikle, PGSC0003DMT400025924 geni bitki bağışıklık sisteminin bir parçası olabilir. Bu çalışmada StBOR1 taşıyıcıları ile etkileşen ve fonksiyonu bilinmeyen üç proteinin biyotik stres altında incelenmesi ileriki çalışmalarda yapılabilir. Benzerlik ağı analizine göre StBOR1-10’un, bu çalışmada incelenen diğer StBOR1 genelerine göre çok daha farklı biyolojik proseslerde yer alabileceği görülmüştür. StBOR1 genlerinin moleküler fonksiyonlarına ışık tutmak için yapılan Gen Ontolojisi (GO) analizine göre üç farklı demet meydana gelmiştir. Genel olarak, StBOR1-8 B alımın, bitki sinyal ve savunma mekanizmasının düzenlenmesinde anahtar bir rol oynadığı görülmektedir. ![]() Aynı zamanda StBOR1-4 ve StBOR1-8’nin Heparanase 1, PGSC0003DMT400010798, ve PGSC0003DMT400030256 proteinleri ile çapraz iletişimi bulunmuştur. 24950 genin 0.99 korelasyon katsayısı ve bir kat ve üzeri eşik değeri dikkate alınarak oluşturulan beş BOR1 geninin, patojenlere karşı bir savunma proteini olan Heparanase 1 ve fonksiyonel olarak tanımı yapılmamış üç farklı genle ko-eksprese edildiği saptanmıştır. Sonuç olarak, BOR1 transporter olarak belirlenen beş transporterın en fazla Benzothiadiazole (BTH) uygulamasında eksprese edildiği bulunmuştur. Ekspresyon ısı haritası ve ko-ekspresyon veri ağları belirlenen beş proteine göre yapılmıştır. On BOR1 taşıyıcısından beş tanesi (StBOR1-2,4,5, ve 10) transkriptomik veri seti içerisinde bulunmuştur. Bu çalışmada patates (Solanum tuberosum) bitkisindeki BOR1 tipi B taşıyıcıları biyoinformatiksel yaklaşımlarla belirlenmiş ve karakterize edilmiştirler. Bitkilerde B taşınımında rol oynayan farklı taşıyıcılar bulunmaktadır. Bor (B) bitki metabolizması için önemli bir mikroelementtir.
0 Comments
Leave a Reply. |
AuthorWrite something about yourself. No need to be fancy, just an overview. ArchivesCategories |